国内刊号:31-1289/TP
国际刊号:1000-3428
发布日期:
作者:朱凌, 王雅萍, 廖丽敏
单位:1. 郑州大学 信息工程学院, 郑州 450001;2. 广东顺德创新设计研究院, 广东 佛山 528311
关键词:数字聚合酶链式反应液滴识别,金字塔卷积网络,多尺度信息,共现注意力,层间相关性,交叉聚合
基金:国家自然科学基金(61772475);国家自然科学青年基金(61906172);河南省高等学校重点科研项目计划(20A510009)。
基于深度学习的数字聚合酶链式反应(PCR)液滴识别对PCR图像中的目标进行高阶语义建模,能够减少人工参与特征设计和筛选带来的误差,但忽略了目标的低层物理结构和几何外观细节信息,且在特征建模的过程中重复使用了大量冗余信息,对特征的表征能力有待改善。提出一种共现流增强双向金字塔卷积网络(CoF-BiPCN)框架用于PCR液滴识别和统计。为增强金字塔的内部和层间相关性,设计具有时空分支的双向金字塔卷积网络,从正反2个方向对金字塔卷积网络得到的多尺度特征进行聚合,模拟PCR图像中液滴的上下文语义以及不同层级的细节信息,以捕获液滴的物理外观等低层信息。同时,设计切片的共现注意力(SCo-AN)模块,将不同尺度的高低层信息在不同的切片子空间中进行共享聚合,并交叉传递到不同分支的BiPCN中,强化高低层特征信息的交互和依赖关系,进一步增强信息流对PCR图像上液滴的表征,实现低层和高阶信息流的共享与交叉聚合。实验结果表明,CoF-BiPCN具备良好的识别性能,准确率和平均精度均值分别达到84.74%和45.09%,与Cascade RCNN模型相比分别提高4.3和3.12个百分点。
来源:2022年第7期
《计算机工程》期刊编辑部